Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU3

HERC6, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC6, humanhuman

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Length 1,022 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC6Q8IVU3 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERC6Q8IVU3 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERC6Q8IVU3 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERC6Q8IVU3 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERC6Q8IVU3 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERC6Q8IVU3 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERC6Q8IVU3 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERC6Q8IVU3 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERC6Q8IVU3 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERC6Q8IVU3 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERC6Q8IVU3 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERC6Q8IVU3 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERC6Q8IVU3 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERC6Q8IVU3 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERC6Q8IVU3 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
HERC6Q8IVU3 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERC6Q8IVU3 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERC6Q8IVU3 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERC6Q8IVU3 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERC6Q8IVU3 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERC6Q8IVU3 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERC6Q8IVU3 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERC6Q8IVU3 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERC6Q8IVU3 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERC6Q8IVU3 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERC6Q8IVU3 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERC6Q8IVU3 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERC6Q8IVU3 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERC6Q8IVU3 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERC6Q8IVU3 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERC6Q8IVU3 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERC6Q8IVU3 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
HERC6Q8IVU3 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERC6Q8IVU3 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERC6Q8IVU3 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERC6Q8IVU3 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERC6Q8IVU3 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERC6Q8IVU3 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERC6Q8IVU3 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERC6Q8IVU3 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERC6Q8IVU3 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERC6Q8IVU3 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERC6Q8IVU3 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERC6Q8IVU3 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERC6Q8IVU3 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERC6Q8IVU3 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERC6Q8IVU3 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERC6Q8IVU3 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERC6Q8IVU3 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERC6Q8IVU3 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERC6Q8IVU3 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERC6Q8IVU3 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERC6Q8IVU3 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERC6Q8IVU3 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERC6Q8IVU3 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERC6Q8IVU3 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERC6Q8IVU3 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERC6Q8IVU3 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERC6Q8IVU3 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
HERC6Q8IVU3 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERC6Q8IVU3 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERC6Q8IVU3 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERC6Q8IVU3 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERC6Q8IVU3 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERC6Q8IVU3 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERC6Q8IVU3 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERC6Q8IVU3 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERC6Q8IVU3 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERC6Q8IVU3 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERC6Q8IVU3 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERC6Q8IVU3 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERC6Q8IVU3 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERC6Q8IVU3 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERC6Q8IVU3 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERC6Q8IVU3 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERC6Q8IVU3 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERC6Q8IVU3 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERC6Q8IVU3 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERC6Q8IVU3 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERC6Q8IVU3 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERC6Q8IVU3 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERC6Q8IVU3 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERC6Q8IVU3 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERC6Q8IVU3 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERC6Q8IVU3 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERC6Q8IVU3 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERC6Q8IVU3 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERC6Q8IVU3 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERC6Q8IVU3 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERC6Q8IVU3 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
HERC6Q8IVU3 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERC6Q8IVU3 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERC6Q8IVU3 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERC6Q8IVU3 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERC6Q8IVU3 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERC6Q8IVU3 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERC6Q8IVU3 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERC6Q8IVU3 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERC6Q8IVU3 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERC6Q8IVU3 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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