Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.7 ms