Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2E3

APTX, Aprataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APTXQ7Z2E3 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
APTXQ7Z2E3 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
APTXQ7Z2E3 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
APTXQ7Z2E3 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
APTXQ7Z2E3 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
APTXQ7Z2E3 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
APTXQ7Z2E3 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
APTXQ7Z2E3 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
APTXQ7Z2E3 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
APTXQ7Z2E3 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
APTXQ7Z2E3 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
APTXQ7Z2E3 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
APTXQ7Z2E3 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
APTXQ7Z2E3 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
APTXQ7Z2E3 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
APTXQ7Z2E3 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
APTXQ7Z2E3 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
APTXQ7Z2E3 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
APTXQ7Z2E3 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
APTXQ7Z2E3 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
APTXQ7Z2E3 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
APTXQ7Z2E3 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
APTXQ7Z2E3 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
APTXQ7Z2E3 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
APTXQ7Z2E3 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
APTXQ7Z2E3 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
APTXQ7Z2E3 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
APTXQ7Z2E3 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
APTXQ7Z2E3 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
APTXQ7Z2E3 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
APTXQ7Z2E3 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
APTXQ7Z2E3 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
APTXQ7Z2E3 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
APTXQ7Z2E3 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
APTXQ7Z2E3 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
APTXQ7Z2E3 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
APTXQ7Z2E3 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
APTXQ7Z2E3 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
APTXQ7Z2E3 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
APTXQ7Z2E3 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
APTXQ7Z2E3 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
APTXQ7Z2E3 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
APTXQ7Z2E3 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
APTXQ7Z2E3 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
APTXQ7Z2E3 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
APTXQ7Z2E3 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
APTXQ7Z2E3 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
APTXQ7Z2E3 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
APTXQ7Z2E3 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
APTXQ7Z2E3 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
APTXQ7Z2E3 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
APTXQ7Z2E3 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
APTXQ7Z2E3 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
APTXQ7Z2E3 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
APTXQ7Z2E3 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
APTXQ7Z2E3 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
APTXQ7Z2E3 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
APTXQ7Z2E3 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
APTXQ7Z2E3 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
APTXQ7Z2E3 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
APTXQ7Z2E3 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
APTXQ7Z2E3 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
APTXQ7Z2E3 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
APTXQ7Z2E3 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
APTXQ7Z2E3 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
APTXQ7Z2E3 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
APTXQ7Z2E3 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
APTXQ7Z2E3 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
APTXQ7Z2E3 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
APTXQ7Z2E3 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
APTXQ7Z2E3 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
APTXQ7Z2E3 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
APTXQ7Z2E3 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
APTXQ7Z2E3 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
APTXQ7Z2E3 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
APTXQ7Z2E3 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
APTXQ7Z2E3 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
APTXQ7Z2E3 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
APTXQ7Z2E3 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
APTXQ7Z2E3 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
APTXQ7Z2E3 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
APTXQ7Z2E3 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
APTXQ7Z2E3 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
APTXQ7Z2E3 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
APTXQ7Z2E3 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
APTXQ7Z2E3 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
APTXQ7Z2E3 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
APTXQ7Z2E3 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
APTXQ7Z2E3 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
APTXQ7Z2E3 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
APTXQ7Z2E3 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
APTXQ7Z2E3 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
APTXQ7Z2E3 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
APTXQ7Z2E3 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
APTXQ7Z2E3 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
APTXQ7Z2E3 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
APTXQ7Z2E3 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
APTXQ7Z2E3 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
APTXQ7Z2E3 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
APTXQ7Z2E3 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms