Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRI6

C15orf39, Uncharacterized protein C15orf39, humanhuman

Predictions only

Length 1,047 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C15orf39Q6ZRI6 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C15orf39Q6ZRI6 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C15orf39Q6ZRI6 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C15orf39Q6ZRI6 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C15orf39Q6ZRI6 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C15orf39Q6ZRI6 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C15orf39Q6ZRI6 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C15orf39Q6ZRI6 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C15orf39Q6ZRI6 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
C15orf39Q6ZRI6 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
C15orf39Q6ZRI6 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C15orf39Q6ZRI6 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C15orf39Q6ZRI6 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C15orf39Q6ZRI6 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C15orf39Q6ZRI6 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C15orf39Q6ZRI6 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
C15orf39Q6ZRI6 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C15orf39Q6ZRI6 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C15orf39Q6ZRI6 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C15orf39Q6ZRI6 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C15orf39Q6ZRI6 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C15orf39Q6ZRI6 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
C15orf39Q6ZRI6 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C15orf39Q6ZRI6 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C15orf39Q6ZRI6 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C15orf39Q6ZRI6 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C15orf39Q6ZRI6 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C15orf39Q6ZRI6 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C15orf39Q6ZRI6 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C15orf39Q6ZRI6 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C15orf39Q6ZRI6 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C15orf39Q6ZRI6 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C15orf39Q6ZRI6 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C15orf39Q6ZRI6 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C15orf39Q6ZRI6 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C15orf39Q6ZRI6 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C15orf39Q6ZRI6 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C15orf39Q6ZRI6 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C15orf39Q6ZRI6 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C15orf39Q6ZRI6 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C15orf39Q6ZRI6 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C15orf39Q6ZRI6 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C15orf39Q6ZRI6 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C15orf39Q6ZRI6 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C15orf39Q6ZRI6 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C15orf39Q6ZRI6 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C15orf39Q6ZRI6 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C15orf39Q6ZRI6 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C15orf39Q6ZRI6 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C15orf39Q6ZRI6 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
C15orf39Q6ZRI6 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C15orf39Q6ZRI6 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C15orf39Q6ZRI6 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C15orf39Q6ZRI6 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C15orf39Q6ZRI6 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C15orf39Q6ZRI6 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C15orf39Q6ZRI6 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C15orf39Q6ZRI6 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C15orf39Q6ZRI6 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C15orf39Q6ZRI6 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C15orf39Q6ZRI6 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C15orf39Q6ZRI6 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C15orf39Q6ZRI6 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C15orf39Q6ZRI6 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C15orf39Q6ZRI6 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
C15orf39Q6ZRI6 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C15orf39Q6ZRI6 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C15orf39Q6ZRI6 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
C15orf39Q6ZRI6 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
C15orf39Q6ZRI6 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C15orf39Q6ZRI6 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C15orf39Q6ZRI6 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C15orf39Q6ZRI6 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C15orf39Q6ZRI6 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C15orf39Q6ZRI6 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C15orf39Q6ZRI6 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C15orf39Q6ZRI6 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C15orf39Q6ZRI6 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
C15orf39Q6ZRI6 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C15orf39Q6ZRI6 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
C15orf39Q6ZRI6 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C15orf39Q6ZRI6 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C15orf39Q6ZRI6 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
C15orf39Q6ZRI6 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C15orf39Q6ZRI6 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
C15orf39Q6ZRI6 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C15orf39Q6ZRI6 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C15orf39Q6ZRI6 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C15orf39Q6ZRI6 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C15orf39Q6ZRI6 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
C15orf39Q6ZRI6 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
C15orf39Q6ZRI6 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
C15orf39Q6ZRI6 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C15orf39Q6ZRI6 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C15orf39Q6ZRI6 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
C15orf39Q6ZRI6 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C15orf39Q6ZRI6 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
C15orf39Q6ZRI6 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
C15orf39Q6ZRI6 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
C15orf39Q6ZRI6 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74 ms