Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMU5

TRIM72, Tripartite motif-containing protein 72, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM72Q6ZMU5 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM72Q6ZMU5 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM72Q6ZMU5 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM72Q6ZMU5 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM72Q6ZMU5 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM72Q6ZMU5 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM72Q6ZMU5 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM72Q6ZMU5 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM72Q6ZMU5 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM72Q6ZMU5 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM72Q6ZMU5 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM72Q6ZMU5 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM72Q6ZMU5 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM72Q6ZMU5 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM72Q6ZMU5 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM72Q6ZMU5 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM72Q6ZMU5 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM72Q6ZMU5 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM72Q6ZMU5 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM72Q6ZMU5 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM72Q6ZMU5 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM72Q6ZMU5 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM72Q6ZMU5 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM72Q6ZMU5 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM72Q6ZMU5 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM72Q6ZMU5 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM72Q6ZMU5 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM72Q6ZMU5 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM72Q6ZMU5 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM72Q6ZMU5 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM72Q6ZMU5 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM72Q6ZMU5 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM72Q6ZMU5 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM72Q6ZMU5 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM72Q6ZMU5 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM72Q6ZMU5 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM72Q6ZMU5 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM72Q6ZMU5 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM72Q6ZMU5 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM72Q6ZMU5 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM72Q6ZMU5 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM72Q6ZMU5 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM72Q6ZMU5 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM72Q6ZMU5 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM72Q6ZMU5 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM72Q6ZMU5 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM72Q6ZMU5 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM72Q6ZMU5 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM72Q6ZMU5 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM72Q6ZMU5 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM72Q6ZMU5 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM72Q6ZMU5 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM72Q6ZMU5 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM72Q6ZMU5 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM72Q6ZMU5 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM72Q6ZMU5 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM72Q6ZMU5 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM72Q6ZMU5 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM72Q6ZMU5 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM72Q6ZMU5 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM72Q6ZMU5 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM72Q6ZMU5 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM72Q6ZMU5 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM72Q6ZMU5 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM72Q6ZMU5 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM72Q6ZMU5 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM72Q6ZMU5 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM72Q6ZMU5 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM72Q6ZMU5 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM72Q6ZMU5 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM72Q6ZMU5 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM72Q6ZMU5 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM72Q6ZMU5 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM72Q6ZMU5 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM72Q6ZMU5 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM72Q6ZMU5 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM72Q6ZMU5 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM72Q6ZMU5 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM72Q6ZMU5 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM72Q6ZMU5 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM72Q6ZMU5 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM72Q6ZMU5 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM72Q6ZMU5 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM72Q6ZMU5 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM72Q6ZMU5 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM72Q6ZMU5 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM72Q6ZMU5 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM72Q6ZMU5 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM72Q6ZMU5 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM72Q6ZMU5 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM72Q6ZMU5 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM72Q6ZMU5 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM72Q6ZMU5 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM72Q6ZMU5 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM72Q6ZMU5 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM72Q6ZMU5 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM72Q6ZMU5 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM72Q6ZMU5 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM72Q6ZMU5 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM72Q6ZMU5 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.2 ms