Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

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Length 1,119 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms