Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC174Q6PII3 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
CCDC174Q6PII3 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
CCDC174Q6PII3 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
CCDC174Q6PII3 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC174Q6PII3 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC174Q6PII3 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC174Q6PII3 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC174Q6PII3 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC174Q6PII3 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC174Q6PII3 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC174Q6PII3 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC174Q6PII3 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC174Q6PII3 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC174Q6PII3 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC174Q6PII3 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC174Q6PII3 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC174Q6PII3 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC174Q6PII3 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC174Q6PII3 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC174Q6PII3 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC174Q6PII3 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC174Q6PII3 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC174Q6PII3 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC174Q6PII3 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC174Q6PII3 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC174Q6PII3 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC174Q6PII3 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC174Q6PII3 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC174Q6PII3 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC174Q6PII3 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC174Q6PII3 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC174Q6PII3 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC174Q6PII3 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC174Q6PII3 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC174Q6PII3 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms