Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CARMIL2Q6F5E8 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CARMIL2Q6F5E8 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CARMIL2Q6F5E8 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CARMIL2Q6F5E8 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CARMIL2Q6F5E8 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CARMIL2Q6F5E8 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CARMIL2Q6F5E8 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CARMIL2Q6F5E8 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CARMIL2Q6F5E8 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CARMIL2Q6F5E8 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CARMIL2Q6F5E8 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CARMIL2Q6F5E8 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CARMIL2Q6F5E8 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CARMIL2Q6F5E8 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CARMIL2Q6F5E8 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CARMIL2Q6F5E8 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CARMIL2Q6F5E8 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CARMIL2Q6F5E8 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CARMIL2Q6F5E8 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CARMIL2Q6F5E8 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CARMIL2Q6F5E8 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CARMIL2Q6F5E8 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CARMIL2Q6F5E8 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CARMIL2Q6F5E8 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CARMIL2Q6F5E8 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CARMIL2Q6F5E8 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CARMIL2Q6F5E8 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CARMIL2Q6F5E8 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CARMIL2Q6F5E8 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CARMIL2Q6F5E8 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CARMIL2Q6F5E8 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CARMIL2Q6F5E8 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CARMIL2Q6F5E8 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CARMIL2Q6F5E8 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CARMIL2Q6F5E8 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CARMIL2Q6F5E8 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
CARMIL2Q6F5E8 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CARMIL2Q6F5E8 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
CARMIL2Q6F5E8 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CARMIL2Q6F5E8 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CARMIL2Q6F5E8 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CARMIL2Q6F5E8 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CARMIL2Q6F5E8 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CARMIL2Q6F5E8 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CARMIL2Q6F5E8 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CARMIL2Q6F5E8 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CARMIL2Q6F5E8 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CARMIL2Q6F5E8 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CARMIL2Q6F5E8 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CARMIL2Q6F5E8 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CARMIL2Q6F5E8 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CARMIL2Q6F5E8 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CARMIL2Q6F5E8 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CARMIL2Q6F5E8 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CARMIL2Q6F5E8 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CARMIL2Q6F5E8 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CARMIL2Q6F5E8 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CARMIL2Q6F5E8 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CARMIL2Q6F5E8 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CARMIL2Q6F5E8 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CARMIL2Q6F5E8 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CARMIL2Q6F5E8 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CARMIL2Q6F5E8 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CARMIL2Q6F5E8 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CARMIL2Q6F5E8 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CARMIL2Q6F5E8 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CARMIL2Q6F5E8 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CARMIL2Q6F5E8 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CARMIL2Q6F5E8 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CARMIL2Q6F5E8 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CARMIL2Q6F5E8 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CARMIL2Q6F5E8 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CARMIL2Q6F5E8 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CARMIL2Q6F5E8 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CARMIL2Q6F5E8 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CARMIL2Q6F5E8 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CARMIL2Q6F5E8 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CARMIL2Q6F5E8 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CARMIL2Q6F5E8 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CARMIL2Q6F5E8 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CARMIL2Q6F5E8 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CARMIL2Q6F5E8 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CARMIL2Q6F5E8 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CARMIL2Q6F5E8 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CARMIL2Q6F5E8 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CARMIL2Q6F5E8 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CARMIL2Q6F5E8 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CARMIL2Q6F5E8 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CARMIL2Q6F5E8 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CARMIL2Q6F5E8 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CARMIL2Q6F5E8 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CARMIL2Q6F5E8 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CARMIL2Q6F5E8 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CARMIL2Q6F5E8 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CARMIL2Q6F5E8 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CARMIL2Q6F5E8 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CARMIL2Q6F5E8 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CARMIL2Q6F5E8 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CARMIL2Q6F5E8 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.2 ms