Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y0

SLC39A12, Zinc transporter ZIP12, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A12Q504Y0 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC39A12Q504Y0 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC39A12Q504Y0 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC39A12Q504Y0 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC39A12Q504Y0 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC39A12Q504Y0 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC39A12Q504Y0 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC39A12Q504Y0 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC39A12Q504Y0 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC39A12Q504Y0 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC39A12Q504Y0 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC39A12Q504Y0 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC39A12Q504Y0 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC39A12Q504Y0 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC39A12Q504Y0 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC39A12Q504Y0 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC39A12Q504Y0 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC39A12Q504Y0 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC39A12Q504Y0 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC39A12Q504Y0 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC39A12Q504Y0 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC39A12Q504Y0 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC39A12Q504Y0 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC39A12Q504Y0 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC39A12Q504Y0 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC39A12Q504Y0 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC39A12Q504Y0 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC39A12Q504Y0 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC39A12Q504Y0 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC39A12Q504Y0 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC39A12Q504Y0 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC39A12Q504Y0 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC39A12Q504Y0 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC39A12Q504Y0 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC39A12Q504Y0 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC39A12Q504Y0 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC39A12Q504Y0 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC39A12Q504Y0 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC39A12Q504Y0 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC39A12Q504Y0 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC39A12Q504Y0 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC39A12Q504Y0 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC39A12Q504Y0 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC39A12Q504Y0 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC39A12Q504Y0 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC39A12Q504Y0 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC39A12Q504Y0 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC39A12Q504Y0 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC39A12Q504Y0 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC39A12Q504Y0 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC39A12Q504Y0 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC39A12Q504Y0 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC39A12Q504Y0 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC39A12Q504Y0 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC39A12Q504Y0 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC39A12Q504Y0 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC39A12Q504Y0 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC39A12Q504Y0 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC39A12Q504Y0 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC39A12Q504Y0 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC39A12Q504Y0 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC39A12Q504Y0 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC39A12Q504Y0 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC39A12Q504Y0 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC39A12Q504Y0 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC39A12Q504Y0 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC39A12Q504Y0 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC39A12Q504Y0 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC39A12Q504Y0 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC39A12Q504Y0 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC39A12Q504Y0 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC39A12Q504Y0 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC39A12Q504Y0 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC39A12Q504Y0 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC39A12Q504Y0 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC39A12Q504Y0 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC39A12Q504Y0 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC39A12Q504Y0 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC39A12Q504Y0 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC39A12Q504Y0 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC39A12Q504Y0 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC39A12Q504Y0 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC39A12Q504Y0 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC39A12Q504Y0 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC39A12Q504Y0 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC39A12Q504Y0 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC39A12Q504Y0 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC39A12Q504Y0 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC39A12Q504Y0 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC39A12Q504Y0 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC39A12Q504Y0 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC39A12Q504Y0 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC39A12Q504Y0 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC39A12Q504Y0 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC39A12Q504Y0 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC39A12Q504Y0 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC39A12Q504Y0 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC39A12Q504Y0 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC39A12Q504Y0 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC39A12Q504Y0 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 221.3 ms