Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
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GEN1Q17RS7 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
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GEN1Q17RS7 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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GEN1Q17RS7 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
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GEN1Q17RS7 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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GEN1Q17RS7 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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