Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC12.82□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
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RTL8BQ17RB0 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
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RTL8BQ17RB0 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC12.81□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
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