Protein–RNA interactions for Protein: Q17R98

ZNF827, Zinc finger protein 827, humanhuman

Predictions only

Length 1,081 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF827Q17R98 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ZNF827Q17R98 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
ZNF827Q17R98 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ZNF827Q17R98 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ZNF827Q17R98 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ZNF827Q17R98 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ZNF827Q17R98 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZNF827Q17R98 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZNF827Q17R98 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZNF827Q17R98 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZNF827Q17R98 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZNF827Q17R98 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZNF827Q17R98 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZNF827Q17R98 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZNF827Q17R98 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZNF827Q17R98 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZNF827Q17R98 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZNF827Q17R98 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZNF827Q17R98 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZNF827Q17R98 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZNF827Q17R98 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZNF827Q17R98 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZNF827Q17R98 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZNF827Q17R98 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZNF827Q17R98 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
ZNF827Q17R98 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
ZNF827Q17R98 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZNF827Q17R98 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZNF827Q17R98 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZNF827Q17R98 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZNF827Q17R98 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZNF827Q17R98 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZNF827Q17R98 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZNF827Q17R98 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZNF827Q17R98 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZNF827Q17R98 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZNF827Q17R98 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZNF827Q17R98 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZNF827Q17R98 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZNF827Q17R98 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZNF827Q17R98 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZNF827Q17R98 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZNF827Q17R98 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZNF827Q17R98 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZNF827Q17R98 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZNF827Q17R98 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZNF827Q17R98 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZNF827Q17R98 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZNF827Q17R98 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZNF827Q17R98 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZNF827Q17R98 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZNF827Q17R98 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZNF827Q17R98 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZNF827Q17R98 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
ZNF827Q17R98 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZNF827Q17R98 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZNF827Q17R98 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
ZNF827Q17R98 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZNF827Q17R98 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZNF827Q17R98 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZNF827Q17R98 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
ZNF827Q17R98 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
ZNF827Q17R98 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
ZNF827Q17R98 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
ZNF827Q17R98 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZNF827Q17R98 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZNF827Q17R98 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZNF827Q17R98 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZNF827Q17R98 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZNF827Q17R98 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZNF827Q17R98 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZNF827Q17R98 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZNF827Q17R98 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ZNF827Q17R98 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ZNF827Q17R98 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ZNF827Q17R98 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ZNF827Q17R98 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
ZNF827Q17R98 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ZNF827Q17R98 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ZNF827Q17R98 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ZNF827Q17R98 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ZNF827Q17R98 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ZNF827Q17R98 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ZNF827Q17R98 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ZNF827Q17R98 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
ZNF827Q17R98 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ZNF827Q17R98 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
ZNF827Q17R98 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ZNF827Q17R98 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ZNF827Q17R98 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
ZNF827Q17R98 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
ZNF827Q17R98 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ZNF827Q17R98 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ZNF827Q17R98 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
ZNF827Q17R98 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
ZNF827Q17R98 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ZNF827Q17R98 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ZNF827Q17R98 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ZNF827Q17R98 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ZNF827Q17R98 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms