Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
DDB1Q16531 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
DDB1Q16531 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DDB1Q16531 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DDB1Q16531 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DDB1Q16531 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
DDB1Q16531 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DDB1Q16531 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
DDB1Q16531 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
DDB1Q16531 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
DDB1Q16531 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
DDB1Q16531 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DDB1Q16531 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC20■□□□□ 0.79
DDB1Q16531 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DDB1Q16531 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DDB1Q16531 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC20■□□□□ 0.79
DDB1Q16531 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
DDB1Q16531 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DDB1Q16531 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
DDB1Q16531 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
DDB1Q16531 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
DDB1Q16531 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
DDB1Q16531 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DDB1Q16531 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DDB1Q16531 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DDB1Q16531 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DDB1Q16531 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DDB1Q16531 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DDB1Q16531 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
DDB1Q16531 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
DDB1Q16531 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
DDB1Q16531 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DDB1Q16531 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
DDB1Q16531 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
DDB1Q16531 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DDB1Q16531 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DDB1Q16531 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DDB1Q16531 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DDB1Q16531 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DDB1Q16531 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DDB1Q16531 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DDB1Q16531 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DDB1Q16531 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DDB1Q16531 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DDB1Q16531 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DDB1Q16531 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DDB1Q16531 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
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DDB1Q16531 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DDB1Q16531 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DDB1Q16531 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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DDB1Q16531 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DDB1Q16531 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
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DDB1Q16531 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DDB1Q16531 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DDB1Q16531 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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DDB1Q16531 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DDB1Q16531 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DDB1Q16531 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DDB1Q16531 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DDB1Q16531 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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DDB1Q16531 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DDB1Q16531 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DDB1Q16531 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
DDB1Q16531 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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DDB1Q16531 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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DDB1Q16531 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
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DDB1Q16531 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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DDB1Q16531 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DDB1Q16531 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DDB1Q16531 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DDB1Q16531 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DDB1Q16531 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DDB1Q16531 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DDB1Q16531 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DDB1Q16531 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DDB1Q16531 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DDB1Q16531 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DDB1Q16531 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DDB1Q16531 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
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