Protein–RNA interactions for Protein: Q16527

CSRP2, Cysteine and glycine-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP2Q16527 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSRP2Q16527 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSRP2Q16527 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSRP2Q16527 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSRP2Q16527 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSRP2Q16527 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSRP2Q16527 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSRP2Q16527 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSRP2Q16527 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CSRP2Q16527 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSRP2Q16527 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSRP2Q16527 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSRP2Q16527 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSRP2Q16527 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CSRP2Q16527 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSRP2Q16527 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CSRP2Q16527 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CSRP2Q16527 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CSRP2Q16527 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSRP2Q16527 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSRP2Q16527 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSRP2Q16527 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSRP2Q16527 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSRP2Q16527 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSRP2Q16527 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CSRP2Q16527 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSRP2Q16527 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSRP2Q16527 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSRP2Q16527 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSRP2Q16527 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSRP2Q16527 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSRP2Q16527 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSRP2Q16527 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSRP2Q16527 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSRP2Q16527 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSRP2Q16527 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSRP2Q16527 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSRP2Q16527 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSRP2Q16527 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSRP2Q16527 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSRP2Q16527 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSRP2Q16527 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSRP2Q16527 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSRP2Q16527 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSRP2Q16527 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSRP2Q16527 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSRP2Q16527 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSRP2Q16527 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSRP2Q16527 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSRP2Q16527 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSRP2Q16527 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSRP2Q16527 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSRP2Q16527 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSRP2Q16527 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSRP2Q16527 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CSRP2Q16527 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSRP2Q16527 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSRP2Q16527 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSRP2Q16527 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSRP2Q16527 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSRP2Q16527 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSRP2Q16527 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSRP2Q16527 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSRP2Q16527 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CSRP2Q16527 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSRP2Q16527 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CSRP2Q16527 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSRP2Q16527 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSRP2Q16527 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSRP2Q16527 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSRP2Q16527 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSRP2Q16527 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CSRP2Q16527 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSRP2Q16527 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSRP2Q16527 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSRP2Q16527 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CSRP2Q16527 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSRP2Q16527 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSRP2Q16527 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSRP2Q16527 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSRP2Q16527 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSRP2Q16527 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSRP2Q16527 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSRP2Q16527 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSRP2Q16527 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSRP2Q16527 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSRP2Q16527 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSRP2Q16527 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSRP2Q16527 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSRP2Q16527 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSRP2Q16527 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSRP2Q16527 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSRP2Q16527 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSRP2Q16527 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSRP2Q16527 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CSRP2Q16527 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CSRP2Q16527 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CSRP2Q16527 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CSRP2Q16527 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CSRP2Q16527 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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