Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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CNGA3Q16281 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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CNGA3Q16281 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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CNGA3Q16281 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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CNGA3Q16281 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
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CNGA3Q16281 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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CNGA3Q16281 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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CNGA3Q16281 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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