Protein–RNA interactions for Protein: Q15929

ZNF56, Putative zinc finger protein 56, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF56Q15929 RAB18-208ENST00000611151 4931 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 IRS1-201ENST00000305123 9705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 BDKRB2-202ENST00000542454 6845 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 MTMR3-204ENST00000401950 6018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC11.49□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 ARAP1-202ENST00000359373 5767 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 SATB2-201ENST00000260926 5318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 JMJD6-208ENST00000617192 5517 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 UBE3A-226ENST00000637886 8725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 ASXL1-201ENST00000306058 6591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 DSE-201ENST00000331677 7237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 SLC4A7-203ENST00000425128 7970 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms