Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms