Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRKQ15262 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRKQ15262 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRKQ15262 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRKQ15262 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRKQ15262 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRKQ15262 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRKQ15262 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRKQ15262 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRKQ15262 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRKQ15262 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRKQ15262 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRKQ15262 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRKQ15262 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRKQ15262 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRKQ15262 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRKQ15262 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRKQ15262 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRKQ15262 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRKQ15262 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRKQ15262 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPRKQ15262 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPRKQ15262 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPRKQ15262 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPRKQ15262 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPRKQ15262 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPRKQ15262 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
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PTPRKQ15262 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPRKQ15262 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPRKQ15262 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPRKQ15262 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPRKQ15262 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPRKQ15262 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPRKQ15262 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPRKQ15262 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPRKQ15262 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPRKQ15262 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPRKQ15262 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPRKQ15262 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPRKQ15262 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPRKQ15262 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PTPRKQ15262 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PTPRKQ15262 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PTPRKQ15262 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PTPRKQ15262 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PTPRKQ15262 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PTPRKQ15262 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PTPRKQ15262 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PTPRKQ15262 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PTPRKQ15262 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PTPRKQ15262 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
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PTPRKQ15262 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
PTPRKQ15262 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PTPRKQ15262 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
PTPRKQ15262 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
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PTPRKQ15262 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.28
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PTPRKQ15262 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPRKQ15262 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPRKQ15262 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPRKQ15262 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
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PTPRKQ15262 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
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PTPRKQ15262 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPRKQ15262 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPRKQ15262 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPRKQ15262 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPRKQ15262 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPRKQ15262 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPRKQ15262 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPRKQ15262 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPRKQ15262 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPRKQ15262 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRKQ15262 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRKQ15262 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRKQ15262 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRKQ15262 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRKQ15262 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRKQ15262 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRKQ15262 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRKQ15262 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRKQ15262 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRKQ15262 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRKQ15262 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRKQ15262 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRKQ15262 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRKQ15262 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
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