Protein–RNA interactions for Protein: Q15006

EMC2, ER membrane protein complex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMC2Q15006 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EMC2Q15006 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EMC2Q15006 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EMC2Q15006 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EMC2Q15006 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EMC2Q15006 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EMC2Q15006 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EMC2Q15006 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EMC2Q15006 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EMC2Q15006 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EMC2Q15006 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EMC2Q15006 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
EMC2Q15006 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EMC2Q15006 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
EMC2Q15006 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EMC2Q15006 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EMC2Q15006 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
EMC2Q15006 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EMC2Q15006 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
EMC2Q15006 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EMC2Q15006 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EMC2Q15006 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
EMC2Q15006 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
EMC2Q15006 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EMC2Q15006 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EMC2Q15006 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EMC2Q15006 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EMC2Q15006 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EMC2Q15006 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EMC2Q15006 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EMC2Q15006 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EMC2Q15006 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EMC2Q15006 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EMC2Q15006 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EMC2Q15006 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EMC2Q15006 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EMC2Q15006 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EMC2Q15006 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EMC2Q15006 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EMC2Q15006 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EMC2Q15006 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EMC2Q15006 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EMC2Q15006 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EMC2Q15006 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EMC2Q15006 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EMC2Q15006 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EMC2Q15006 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EMC2Q15006 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EMC2Q15006 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EMC2Q15006 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EMC2Q15006 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EMC2Q15006 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
EMC2Q15006 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EMC2Q15006 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EMC2Q15006 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EMC2Q15006 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EMC2Q15006 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EMC2Q15006 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EMC2Q15006 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EMC2Q15006 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EMC2Q15006 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EMC2Q15006 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
EMC2Q15006 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EMC2Q15006 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EMC2Q15006 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EMC2Q15006 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EMC2Q15006 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EMC2Q15006 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EMC2Q15006 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EMC2Q15006 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EMC2Q15006 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
EMC2Q15006 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
EMC2Q15006 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
EMC2Q15006 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EMC2Q15006 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EMC2Q15006 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
EMC2Q15006 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EMC2Q15006 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EMC2Q15006 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EMC2Q15006 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EMC2Q15006 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
EMC2Q15006 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EMC2Q15006 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EMC2Q15006 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EMC2Q15006 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EMC2Q15006 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EMC2Q15006 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EMC2Q15006 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EMC2Q15006 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EMC2Q15006 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EMC2Q15006 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EMC2Q15006 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EMC2Q15006 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EMC2Q15006 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EMC2Q15006 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EMC2Q15006 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EMC2Q15006 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EMC2Q15006 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EMC2Q15006 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EMC2Q15006 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms