Protein–RNA interactions for Protein: Q14995

NR1D2, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 2, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1D2Q14995 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NR1D2Q14995 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NR1D2Q14995 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NR1D2Q14995 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NR1D2Q14995 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NR1D2Q14995 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NR1D2Q14995 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NR1D2Q14995 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NR1D2Q14995 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NR1D2Q14995 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NR1D2Q14995 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NR1D2Q14995 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NR1D2Q14995 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NR1D2Q14995 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NR1D2Q14995 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NR1D2Q14995 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NR1D2Q14995 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NR1D2Q14995 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NR1D2Q14995 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NR1D2Q14995 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NR1D2Q14995 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NR1D2Q14995 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NR1D2Q14995 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NR1D2Q14995 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NR1D2Q14995 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NR1D2Q14995 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NR1D2Q14995 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NR1D2Q14995 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NR1D2Q14995 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NR1D2Q14995 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NR1D2Q14995 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NR1D2Q14995 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NR1D2Q14995 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NR1D2Q14995 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NR1D2Q14995 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NR1D2Q14995 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NR1D2Q14995 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NR1D2Q14995 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NR1D2Q14995 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NR1D2Q14995 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NR1D2Q14995 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NR1D2Q14995 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NR1D2Q14995 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NR1D2Q14995 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NR1D2Q14995 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NR1D2Q14995 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NR1D2Q14995 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NR1D2Q14995 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NR1D2Q14995 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NR1D2Q14995 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NR1D2Q14995 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NR1D2Q14995 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NR1D2Q14995 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NR1D2Q14995 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NR1D2Q14995 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NR1D2Q14995 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NR1D2Q14995 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NR1D2Q14995 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NR1D2Q14995 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NR1D2Q14995 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NR1D2Q14995 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NR1D2Q14995 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NR1D2Q14995 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NR1D2Q14995 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NR1D2Q14995 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NR1D2Q14995 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NR1D2Q14995 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NR1D2Q14995 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NR1D2Q14995 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NR1D2Q14995 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NR1D2Q14995 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NR1D2Q14995 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NR1D2Q14995 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NR1D2Q14995 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NR1D2Q14995 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NR1D2Q14995 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NR1D2Q14995 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NR1D2Q14995 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NR1D2Q14995 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NR1D2Q14995 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NR1D2Q14995 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NR1D2Q14995 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NR1D2Q14995 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NR1D2Q14995 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NR1D2Q14995 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NR1D2Q14995 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NR1D2Q14995 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NR1D2Q14995 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NR1D2Q14995 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NR1D2Q14995 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NR1D2Q14995 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NR1D2Q14995 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NR1D2Q14995 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NR1D2Q14995 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NR1D2Q14995 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NR1D2Q14995 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NR1D2Q14995 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NR1D2Q14995 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NR1D2Q14995 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NR1D2Q14995 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms