Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CHD4Q14839 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHD4Q14839 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHD4Q14839 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHD4Q14839 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHD4Q14839 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHD4Q14839 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHD4Q14839 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHD4Q14839 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHD4Q14839 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHD4Q14839 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHD4Q14839 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHD4Q14839 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CHD4Q14839 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHD4Q14839 AC004540.1-204ENST00000449537 727 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHD4Q14839 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHD4Q14839 AC010504.1-201ENST00000591311 585 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHD4Q14839 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHD4Q14839 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHD4Q14839 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHD4Q14839 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHD4Q14839 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHD4Q14839 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHD4Q14839 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHD4Q14839 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHD4Q14839 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHD4Q14839 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHD4Q14839 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CHD4Q14839 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHD4Q14839 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHD4Q14839 EHMT2-AS1-201ENST00000434689 373 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHD4Q14839 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHD4Q14839 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
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CHD4Q14839 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
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CHD4Q14839 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
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CHD4Q14839 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
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CHD4Q14839 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
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CHD4Q14839 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
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CHD4Q14839 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CHD4Q14839 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CHD4Q14839 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CHD4Q14839 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CHD4Q14839 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CHD4Q14839 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
CHD4Q14839 TTPAL-203ENST00000372906 1139 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CHD4Q14839 AC026410.1-201ENST00000507366 1101 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
CHD4Q14839 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CHD4Q14839 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CHD4Q14839 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CHD4Q14839 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CHD4Q14839 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHD4Q14839 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHD4Q14839 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHD4Q14839 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHD4Q14839 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHD4Q14839 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CHD4Q14839 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHD4Q14839 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHD4Q14839 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHD4Q14839 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHD4Q14839 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHD4Q14839 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHD4Q14839 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
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