Protein–RNA interactions for Protein: Q14722

KCNAB1, Voltage-gated potassium channel subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNAB1Q14722 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
KCNAB1Q14722 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
KCNAB1Q14722 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
KCNAB1Q14722 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
KCNAB1Q14722 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
KCNAB1Q14722 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
KCNAB1Q14722 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
KCNAB1Q14722 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
KCNAB1Q14722 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
KCNAB1Q14722 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
KCNAB1Q14722 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
KCNAB1Q14722 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
KCNAB1Q14722 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
KCNAB1Q14722 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
KCNAB1Q14722 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
KCNAB1Q14722 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
KCNAB1Q14722 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
KCNAB1Q14722 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
KCNAB1Q14722 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
KCNAB1Q14722 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
KCNAB1Q14722 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
KCNAB1Q14722 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
KCNAB1Q14722 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
KCNAB1Q14722 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
KCNAB1Q14722 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
KCNAB1Q14722 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
KCNAB1Q14722 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
KCNAB1Q14722 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
KCNAB1Q14722 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
KCNAB1Q14722 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
KCNAB1Q14722 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
KCNAB1Q14722 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
KCNAB1Q14722 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
KCNAB1Q14722 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
KCNAB1Q14722 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
KCNAB1Q14722 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
KCNAB1Q14722 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
KCNAB1Q14722 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
KCNAB1Q14722 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
KCNAB1Q14722 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
KCNAB1Q14722 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
KCNAB1Q14722 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
KCNAB1Q14722 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
KCNAB1Q14722 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
KCNAB1Q14722 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
KCNAB1Q14722 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
KCNAB1Q14722 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
KCNAB1Q14722 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
KCNAB1Q14722 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
KCNAB1Q14722 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
KCNAB1Q14722 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
KCNAB1Q14722 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
KCNAB1Q14722 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
KCNAB1Q14722 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
KCNAB1Q14722 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
KCNAB1Q14722 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
KCNAB1Q14722 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
KCNAB1Q14722 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
KCNAB1Q14722 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KCNAB1Q14722 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KCNAB1Q14722 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KCNAB1Q14722 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KCNAB1Q14722 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KCNAB1Q14722 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KCNAB1Q14722 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KCNAB1Q14722 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KCNAB1Q14722 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KCNAB1Q14722 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KCNAB1Q14722 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KCNAB1Q14722 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KCNAB1Q14722 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KCNAB1Q14722 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KCNAB1Q14722 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KCNAB1Q14722 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KCNAB1Q14722 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KCNAB1Q14722 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KCNAB1Q14722 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KCNAB1Q14722 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KCNAB1Q14722 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KCNAB1Q14722 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KCNAB1Q14722 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KCNAB1Q14722 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KCNAB1Q14722 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KCNAB1Q14722 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KCNAB1Q14722 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
KCNAB1Q14722 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KCNAB1Q14722 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KCNAB1Q14722 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
KCNAB1Q14722 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KCNAB1Q14722 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KCNAB1Q14722 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KCNAB1Q14722 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KCNAB1Q14722 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KCNAB1Q14722 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KCNAB1Q14722 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KCNAB1Q14722 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KCNAB1Q14722 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KCNAB1Q14722 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KCNAB1Q14722 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KCNAB1Q14722 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms