Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.8 ms