Protein–RNA interactions for Protein: Q14623

IHH, Indian hedgehog protein, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IHHQ14623 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
IHHQ14623 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
IHHQ14623 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
IHHQ14623 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
IHHQ14623 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
IHHQ14623 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
IHHQ14623 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
IHHQ14623 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
IHHQ14623 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
IHHQ14623 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
IHHQ14623 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
IHHQ14623 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
IHHQ14623 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
IHHQ14623 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
IHHQ14623 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
IHHQ14623 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
IHHQ14623 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
IHHQ14623 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
IHHQ14623 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
IHHQ14623 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
IHHQ14623 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
IHHQ14623 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
IHHQ14623 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
IHHQ14623 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
IHHQ14623 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
IHHQ14623 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
IHHQ14623 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
IHHQ14623 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
IHHQ14623 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
IHHQ14623 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
IHHQ14623 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
IHHQ14623 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
IHHQ14623 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
IHHQ14623 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
IHHQ14623 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
IHHQ14623 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
IHHQ14623 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
IHHQ14623 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IHHQ14623 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IHHQ14623 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IHHQ14623 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IHHQ14623 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IHHQ14623 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IHHQ14623 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IHHQ14623 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IHHQ14623 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IHHQ14623 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IHHQ14623 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IHHQ14623 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
IHHQ14623 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
IHHQ14623 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IHHQ14623 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
IHHQ14623 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IHHQ14623 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
IHHQ14623 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IHHQ14623 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
IHHQ14623 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IHHQ14623 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IHHQ14623 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IHHQ14623 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IHHQ14623 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IHHQ14623 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IHHQ14623 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IHHQ14623 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IHHQ14623 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IHHQ14623 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IHHQ14623 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IHHQ14623 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IHHQ14623 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IHHQ14623 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IHHQ14623 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IHHQ14623 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IHHQ14623 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IHHQ14623 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IHHQ14623 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
IHHQ14623 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
IHHQ14623 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IHHQ14623 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IHHQ14623 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IHHQ14623 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IHHQ14623 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IHHQ14623 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IHHQ14623 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IHHQ14623 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IHHQ14623 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IHHQ14623 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IHHQ14623 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
IHHQ14623 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IHHQ14623 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IHHQ14623 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
IHHQ14623 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IHHQ14623 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IHHQ14623 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IHHQ14623 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
IHHQ14623 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IHHQ14623 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IHHQ14623 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IHHQ14623 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IHHQ14623 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
IHHQ14623 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms