Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.1 ms