Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CDK13Q14004 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDK13Q14004 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDK13Q14004 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDK13Q14004 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDK13Q14004 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDK13Q14004 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDK13Q14004 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDK13Q14004 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDK13Q14004 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDK13Q14004 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDK13Q14004 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDK13Q14004 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDK13Q14004 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDK13Q14004 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDK13Q14004 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CDK13Q14004 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDK13Q14004 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDK13Q14004 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDK13Q14004 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDK13Q14004 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDK13Q14004 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDK13Q14004 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDK13Q14004 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDK13Q14004 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDK13Q14004 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDK13Q14004 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CDK13Q14004 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDK13Q14004 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDK13Q14004 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDK13Q14004 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDK13Q14004 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDK13Q14004 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CDK13Q14004 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDK13Q14004 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDK13Q14004 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDK13Q14004 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDK13Q14004 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CDK13Q14004 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDK13Q14004 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDK13Q14004 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDK13Q14004 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDK13Q14004 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDK13Q14004 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDK13Q14004 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDK13Q14004 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDK13Q14004 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDK13Q14004 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDK13Q14004 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDK13Q14004 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDK13Q14004 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDK13Q14004 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDK13Q14004 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDK13Q14004 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDK13Q14004 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDK13Q14004 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDK13Q14004 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDK13Q14004 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDK13Q14004 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDK13Q14004 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDK13Q14004 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDK13Q14004 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CDK13Q14004 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDK13Q14004 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDK13Q14004 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDK13Q14004 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDK13Q14004 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDK13Q14004 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDK13Q14004 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDK13Q14004 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDK13Q14004 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDK13Q14004 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDK13Q14004 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDK13Q14004 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDK13Q14004 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDK13Q14004 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDK13Q14004 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CDK13Q14004 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CDK13Q14004 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDK13Q14004 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CDK13Q14004 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDK13Q14004 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CDK13Q14004 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CDK13Q14004 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CDK13Q14004 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CDK13Q14004 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDK13Q14004 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDK13Q14004 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDK13Q14004 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDK13Q14004 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDK13Q14004 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDK13Q14004 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CDK13Q14004 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CDK13Q14004 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDK13Q14004 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CDK13Q14004 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDK13Q14004 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDK13Q14004 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDK13Q14004 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDK13Q14004 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
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