Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
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