Protein–RNA interactions for Protein: Q13670

PMS2P11, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P11Q13670 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 GRM1-203ENST00000361719 6754 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 NUDT3-201ENST00000607016 9905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms