Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
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CUL1Q13616 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
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CUL1Q13616 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
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CUL1Q13616 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
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CUL1Q13616 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
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