Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PEX6Q13608 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PEX6Q13608 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PEX6Q13608 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PEX6Q13608 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PEX6Q13608 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PEX6Q13608 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PEX6Q13608 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PEX6Q13608 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PEX6Q13608 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PEX6Q13608 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PEX6Q13608 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PEX6Q13608 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PEX6Q13608 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PEX6Q13608 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PEX6Q13608 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PEX6Q13608 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PEX6Q13608 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PEX6Q13608 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PEX6Q13608 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PEX6Q13608 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PEX6Q13608 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PEX6Q13608 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PEX6Q13608 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PEX6Q13608 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PEX6Q13608 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PEX6Q13608 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PEX6Q13608 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PEX6Q13608 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PEX6Q13608 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PEX6Q13608 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PEX6Q13608 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PEX6Q13608 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PEX6Q13608 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PEX6Q13608 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PEX6Q13608 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PEX6Q13608 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PEX6Q13608 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PEX6Q13608 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PEX6Q13608 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PEX6Q13608 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PEX6Q13608 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PEX6Q13608 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PEX6Q13608 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PEX6Q13608 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PEX6Q13608 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PEX6Q13608 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PEX6Q13608 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
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PEX6Q13608 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PEX6Q13608 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PEX6Q13608 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PEX6Q13608 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
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PEX6Q13608 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
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PEX6Q13608 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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PEX6Q13608 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PEX6Q13608 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PEX6Q13608 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PEX6Q13608 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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PEX6Q13608 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PEX6Q13608 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PEX6Q13608 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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PEX6Q13608 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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PEX6Q13608 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PEX6Q13608 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PEX6Q13608 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PEX6Q13608 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PEX6Q13608 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PEX6Q13608 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PEX6Q13608 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PEX6Q13608 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PEX6Q13608 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PEX6Q13608 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PEX6Q13608 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PEX6Q13608 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PEX6Q13608 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PEX6Q13608 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PEX6Q13608 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PEX6Q13608 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PEX6Q13608 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PEX6Q13608 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PEX6Q13608 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PEX6Q13608 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PEX6Q13608 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PEX6Q13608 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PEX6Q13608 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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