Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
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ITGB3BPQ13352 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGB3BPQ13352 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGB3BPQ13352 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGB3BPQ13352 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
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ITGB3BPQ13352 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGB3BPQ13352 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGB3BPQ13352 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGB3BPQ13352 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGB3BPQ13352 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGB3BPQ13352 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGB3BPQ13352 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGB3BPQ13352 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGB3BPQ13352 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGB3BPQ13352 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGB3BPQ13352 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
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ITGB3BPQ13352 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGB3BPQ13352 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGB3BPQ13352 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGB3BPQ13352 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGB3BPQ13352 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
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ITGB3BPQ13352 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGB3BPQ13352 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGB3BPQ13352 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGB3BPQ13352 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGB3BPQ13352 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGB3BPQ13352 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGB3BPQ13352 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
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ITGB3BPQ13352 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGB3BPQ13352 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGB3BPQ13352 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGB3BPQ13352 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
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ITGB3BPQ13352 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
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ITGB3BPQ13352 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGB3BPQ13352 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGB3BPQ13352 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
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ITGB3BPQ13352 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGB3BPQ13352 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
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ITGB3BPQ13352 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGB3BPQ13352 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGB3BPQ13352 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGB3BPQ13352 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGB3BPQ13352 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGB3BPQ13352 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGB3BPQ13352 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGB3BPQ13352 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGB3BPQ13352 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGB3BPQ13352 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGB3BPQ13352 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGB3BPQ13352 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGB3BPQ13352 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGB3BPQ13352 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGB3BPQ13352 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGB3BPQ13352 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGB3BPQ13352 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGB3BPQ13352 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGB3BPQ13352 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGB3BPQ13352 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGB3BPQ13352 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGB3BPQ13352 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGB3BPQ13352 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGB3BPQ13352 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
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