Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRDM2Q13029 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
PRDM2Q13029 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRDM2Q13029 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRDM2Q13029 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRDM2Q13029 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRDM2Q13029 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRDM2Q13029 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRDM2Q13029 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
PRDM2Q13029 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRDM2Q13029 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRDM2Q13029 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRDM2Q13029 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRDM2Q13029 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRDM2Q13029 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRDM2Q13029 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRDM2Q13029 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
PRDM2Q13029 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRDM2Q13029 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRDM2Q13029 AC068397.2-201ENST00000558742 341 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRDM2Q13029 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRDM2Q13029 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRDM2Q13029 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRDM2Q13029 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRDM2Q13029 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
PRDM2Q13029 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRDM2Q13029 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRDM2Q13029 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRDM2Q13029 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRDM2Q13029 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRDM2Q13029 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRDM2Q13029 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRDM2Q13029 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRDM2Q13029 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRDM2Q13029 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PRDM2Q13029 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PRDM2Q13029 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRDM2Q13029 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRDM2Q13029 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PRDM2Q13029 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRDM2Q13029 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRDM2Q13029 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PRDM2Q13029 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRDM2Q13029 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRDM2Q13029 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRDM2Q13029 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRDM2Q13029 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRDM2Q13029 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRDM2Q13029 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRDM2Q13029 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRDM2Q13029 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRDM2Q13029 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRDM2Q13029 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRDM2Q13029 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRDM2Q13029 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PRDM2Q13029 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRDM2Q13029 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRDM2Q13029 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRDM2Q13029 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRDM2Q13029 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRDM2Q13029 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRDM2Q13029 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRDM2Q13029 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRDM2Q13029 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRDM2Q13029 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRDM2Q13029 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRDM2Q13029 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRDM2Q13029 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRDM2Q13029 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRDM2Q13029 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRDM2Q13029 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRDM2Q13029 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRDM2Q13029 AC234644.1-201ENST00000406065 370 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PRDM2Q13029 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRDM2Q13029 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRDM2Q13029 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRDM2Q13029 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRDM2Q13029 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRDM2Q13029 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRDM2Q13029 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PRDM2Q13029 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRDM2Q13029 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRDM2Q13029 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRDM2Q13029 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRDM2Q13029 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRDM2Q13029 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PRDM2Q13029 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRDM2Q13029 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRDM2Q13029 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRDM2Q13029 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRDM2Q13029 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRDM2Q13029 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PRDM2Q13029 AC141586.1-203ENST00000567242 366 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PRDM2Q13029 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PRDM2Q13029 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRDM2Q13029 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRDM2Q13029 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRDM2Q13029 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PRDM2Q13029 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRDM2Q13029 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
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