Protein–RNA interactions for Protein: Q12800

TFCP2, Alpha-globin transcription factor CP2, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFCP2Q12800 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TFCP2Q12800 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TFCP2Q12800 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TFCP2Q12800 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TFCP2Q12800 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TFCP2Q12800 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TFCP2Q12800 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TFCP2Q12800 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TFCP2Q12800 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TFCP2Q12800 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TFCP2Q12800 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TFCP2Q12800 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TFCP2Q12800 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TFCP2Q12800 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TFCP2Q12800 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TFCP2Q12800 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TFCP2Q12800 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TFCP2Q12800 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TFCP2Q12800 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TFCP2Q12800 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TFCP2Q12800 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TFCP2Q12800 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TFCP2Q12800 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TFCP2Q12800 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TFCP2Q12800 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TFCP2Q12800 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TFCP2Q12800 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TFCP2Q12800 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TFCP2Q12800 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TFCP2Q12800 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TFCP2Q12800 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TFCP2Q12800 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TFCP2Q12800 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TFCP2Q12800 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TFCP2Q12800 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TFCP2Q12800 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TFCP2Q12800 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TFCP2Q12800 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
TFCP2Q12800 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TFCP2Q12800 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TFCP2Q12800 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TFCP2Q12800 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
TFCP2Q12800 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TFCP2Q12800 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TFCP2Q12800 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TFCP2Q12800 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TFCP2Q12800 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TFCP2Q12800 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TFCP2Q12800 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TFCP2Q12800 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
TFCP2Q12800 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TFCP2Q12800 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TFCP2Q12800 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TFCP2Q12800 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TFCP2Q12800 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TFCP2Q12800 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TFCP2Q12800 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TFCP2Q12800 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TFCP2Q12800 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TFCP2Q12800 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TFCP2Q12800 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TFCP2Q12800 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TFCP2Q12800 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
TFCP2Q12800 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TFCP2Q12800 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TFCP2Q12800 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
TFCP2Q12800 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TFCP2Q12800 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TFCP2Q12800 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TFCP2Q12800 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TFCP2Q12800 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TFCP2Q12800 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TFCP2Q12800 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TFCP2Q12800 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TFCP2Q12800 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TFCP2Q12800 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TFCP2Q12800 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TFCP2Q12800 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
TFCP2Q12800 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TFCP2Q12800 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TFCP2Q12800 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TFCP2Q12800 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
TFCP2Q12800 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TFCP2Q12800 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TFCP2Q12800 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TFCP2Q12800 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TFCP2Q12800 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TFCP2Q12800 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TFCP2Q12800 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TFCP2Q12800 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TFCP2Q12800 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TFCP2Q12800 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TFCP2Q12800 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TFCP2Q12800 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TFCP2Q12800 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TFCP2Q12800 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TFCP2Q12800 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TFCP2Q12800 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TFCP2Q12800 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TFCP2Q12800 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms