Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms