Protein–RNA interactions for Protein: Q08378

GOLGA3, Golgin subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA3Q08378 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GOLGA3Q08378 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
GOLGA3Q08378 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
GOLGA3Q08378 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
GOLGA3Q08378 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GOLGA3Q08378 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GOLGA3Q08378 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GOLGA3Q08378 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GOLGA3Q08378 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GOLGA3Q08378 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GOLGA3Q08378 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GOLGA3Q08378 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GOLGA3Q08378 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GOLGA3Q08378 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GOLGA3Q08378 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GOLGA3Q08378 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GOLGA3Q08378 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GOLGA3Q08378 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GOLGA3Q08378 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GOLGA3Q08378 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GOLGA3Q08378 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GOLGA3Q08378 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GOLGA3Q08378 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GOLGA3Q08378 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GOLGA3Q08378 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
GOLGA3Q08378 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GOLGA3Q08378 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
GOLGA3Q08378 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GOLGA3Q08378 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
GOLGA3Q08378 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GOLGA3Q08378 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GOLGA3Q08378 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GOLGA3Q08378 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GOLGA3Q08378 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GOLGA3Q08378 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GOLGA3Q08378 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GOLGA3Q08378 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GOLGA3Q08378 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GOLGA3Q08378 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GOLGA3Q08378 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GOLGA3Q08378 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GOLGA3Q08378 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GOLGA3Q08378 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GOLGA3Q08378 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GOLGA3Q08378 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GOLGA3Q08378 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GOLGA3Q08378 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
GOLGA3Q08378 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GOLGA3Q08378 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GOLGA3Q08378 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GOLGA3Q08378 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GOLGA3Q08378 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GOLGA3Q08378 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GOLGA3Q08378 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GOLGA3Q08378 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GOLGA3Q08378 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GOLGA3Q08378 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GOLGA3Q08378 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GOLGA3Q08378 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GOLGA3Q08378 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GOLGA3Q08378 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GOLGA3Q08378 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GOLGA3Q08378 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
GOLGA3Q08378 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GOLGA3Q08378 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
GOLGA3Q08378 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
GOLGA3Q08378 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
GOLGA3Q08378 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
GOLGA3Q08378 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
GOLGA3Q08378 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
GOLGA3Q08378 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GOLGA3Q08378 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GOLGA3Q08378 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GOLGA3Q08378 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GOLGA3Q08378 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GOLGA3Q08378 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GOLGA3Q08378 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GOLGA3Q08378 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GOLGA3Q08378 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GOLGA3Q08378 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GOLGA3Q08378 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GOLGA3Q08378 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GOLGA3Q08378 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GOLGA3Q08378 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GOLGA3Q08378 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GOLGA3Q08378 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GOLGA3Q08378 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GOLGA3Q08378 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GOLGA3Q08378 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
GOLGA3Q08378 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GOLGA3Q08378 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GOLGA3Q08378 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
GOLGA3Q08378 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GOLGA3Q08378 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GOLGA3Q08378 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GOLGA3Q08378 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GOLGA3Q08378 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GOLGA3Q08378 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GOLGA3Q08378 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GOLGA3Q08378 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms