Protein–RNA interactions for Protein: Q08050

FOXM1, Forkhead box protein M1, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXM1Q08050 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXM1Q08050 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXM1Q08050 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXM1Q08050 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXM1Q08050 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXM1Q08050 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXM1Q08050 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXM1Q08050 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXM1Q08050 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXM1Q08050 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXM1Q08050 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXM1Q08050 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXM1Q08050 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXM1Q08050 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXM1Q08050 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXM1Q08050 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXM1Q08050 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXM1Q08050 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXM1Q08050 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXM1Q08050 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXM1Q08050 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXM1Q08050 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXM1Q08050 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXM1Q08050 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXM1Q08050 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXM1Q08050 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXM1Q08050 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXM1Q08050 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXM1Q08050 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXM1Q08050 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXM1Q08050 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXM1Q08050 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXM1Q08050 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXM1Q08050 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXM1Q08050 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXM1Q08050 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXM1Q08050 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXM1Q08050 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXM1Q08050 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXM1Q08050 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXM1Q08050 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXM1Q08050 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXM1Q08050 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXM1Q08050 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXM1Q08050 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXM1Q08050 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXM1Q08050 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXM1Q08050 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXM1Q08050 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXM1Q08050 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXM1Q08050 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXM1Q08050 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXM1Q08050 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXM1Q08050 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXM1Q08050 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXM1Q08050 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXM1Q08050 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXM1Q08050 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXM1Q08050 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXM1Q08050 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXM1Q08050 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXM1Q08050 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXM1Q08050 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXM1Q08050 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXM1Q08050 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXM1Q08050 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXM1Q08050 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXM1Q08050 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXM1Q08050 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXM1Q08050 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXM1Q08050 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXM1Q08050 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXM1Q08050 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXM1Q08050 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXM1Q08050 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXM1Q08050 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXM1Q08050 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXM1Q08050 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXM1Q08050 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXM1Q08050 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXM1Q08050 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXM1Q08050 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXM1Q08050 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXM1Q08050 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXM1Q08050 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXM1Q08050 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXM1Q08050 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXM1Q08050 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXM1Q08050 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXM1Q08050 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXM1Q08050 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXM1Q08050 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXM1Q08050 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXM1Q08050 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXM1Q08050 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXM1Q08050 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXM1Q08050 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXM1Q08050 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXM1Q08050 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXM1Q08050 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms