Protein–RNA interactions for Protein: Q06547

GABPB1, GA-binding protein subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1Q06547 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 TRIM46-205ENST00000392451 3195 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 NPTN-IT1-201ENST00000628401 2283 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 ALKBH5-201ENST00000399138 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 OFD1-201ENST00000340096 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 PSD-202ENST00000406432 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 AL022323.5-201ENST00000624101 2059 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 CPEB4-208ENST00000520867 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 NECAP2-202ENST00000443980 1929 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 RAB37-202ENST00000392610 2858 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 ALOX15B-202ENST00000380183 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 AAAS-202ENST00000394384 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 SLC26A6-202ENST00000337000 2317 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 LINC01301-202ENST00000506428 2444 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 ZNF778-202ENST00000433976 3608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96 ms