Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.3 ms