Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107 ms