Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms