Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms