Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 CKMT2-203ENST00000437669 1479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 FCRLA-202ENST00000294796 766 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 FCRLA-203ENST00000309691 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 OR4K13-201ENST00000315693 915 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 LINC01393-201ENST00000419905 746 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 AC073188.3-201ENST00000425228 339 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 MOB1AP2-201ENST00000446060 614 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 RAP1BP2-201ENST00000478270 544 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 AC084116.3-201ENST00000519123 429 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 AL049870.2-201ENST00000554389 693 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 AC103982.1-201ENST00000561358 571 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 AC138907.2-201ENST00000561479 866 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 AC145350.4-201ENST00000562827 866 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 AC133485.5-201ENST00000563407 866 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 AC040173.1-201ENST00000572479 580 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 AC080078.2-201ENST00000603766 501 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 AC105402.3-203ENST00000608822 885 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 AC079779.3-218ENST00000612487 940 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 MGP-203ENST00000539261 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 RNU5E-4P-201ENST00000364931 120 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 MTCO3P43-201ENST00000440974 771 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 TAAR4P-201ENST00000454843 1039 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 ANK3-207ENST00000460468 677 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 ANK3-213ENST00000486349 493 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 GTF2IP9-201ENST00000502460 301 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 AC005774.1-201ENST00000565247 567 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 AC015845.1-201ENST00000579285 335 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 LINC01899-202ENST00000583756 575 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 RNASEH2B-AS1-206ENST00000601286 657 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 AC007497.1-201ENST00000610421 561 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 AC024941.1-201ENST00000612250 334 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 C2-AS1-201ENST00000630806 762 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 KLRC1-201ENST00000347831 1332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.2 ms