Protein–RNA interactions for Protein: Q02223

TNFRSF17, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF17Q02223 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.4 ms