Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms