Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms