Protein–RNA interactions for Protein: P98194

ATP2C1, Calcium-transporting ATPase type 2C member 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2C1P98194 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP2C1P98194 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP2C1P98194 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP2C1P98194 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP2C1P98194 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP2C1P98194 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP2C1P98194 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP2C1P98194 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP2C1P98194 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP2C1P98194 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP2C1P98194 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP2C1P98194 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP2C1P98194 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP2C1P98194 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP2C1P98194 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP2C1P98194 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP2C1P98194 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP2C1P98194 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP2C1P98194 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP2C1P98194 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP2C1P98194 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP2C1P98194 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP2C1P98194 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP2C1P98194 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP2C1P98194 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP2C1P98194 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP2C1P98194 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP2C1P98194 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP2C1P98194 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP2C1P98194 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP2C1P98194 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP2C1P98194 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP2C1P98194 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP2C1P98194 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP2C1P98194 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP2C1P98194 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP2C1P98194 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP2C1P98194 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP2C1P98194 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP2C1P98194 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP2C1P98194 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP2C1P98194 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP2C1P98194 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP2C1P98194 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP2C1P98194 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP2C1P98194 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP2C1P98194 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP2C1P98194 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP2C1P98194 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP2C1P98194 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP2C1P98194 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP2C1P98194 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP2C1P98194 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP2C1P98194 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP2C1P98194 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ATP2C1P98194 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ATP2C1P98194 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ATP2C1P98194 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ATP2C1P98194 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ATP2C1P98194 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ATP2C1P98194 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ATP2C1P98194 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ATP2C1P98194 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ATP2C1P98194 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
ATP2C1P98194 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP2C1P98194 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP2C1P98194 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP2C1P98194 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP2C1P98194 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP2C1P98194 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP2C1P98194 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP2C1P98194 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP2C1P98194 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP2C1P98194 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP2C1P98194 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP2C1P98194 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP2C1P98194 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP2C1P98194 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP2C1P98194 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP2C1P98194 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP2C1P98194 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP2C1P98194 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP2C1P98194 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP2C1P98194 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP2C1P98194 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP2C1P98194 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP2C1P98194 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP2C1P98194 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP2C1P98194 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP2C1P98194 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP2C1P98194 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP2C1P98194 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP2C1P98194 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP2C1P98194 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP2C1P98194 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP2C1P98194 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP2C1P98194 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP2C1P98194 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP2C1P98194 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP2C1P98194 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms