Protein–RNA interactions for Protein: P78545

ELF3, ETS-related transcription factor Elf-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELF3P78545 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELF3P78545 SEPT6-201ENST00000343984 2693 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELF3P78545 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELF3P78545 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELF3P78545 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELF3P78545 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELF3P78545 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ELF3P78545 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELF3P78545 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELF3P78545 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELF3P78545 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELF3P78545 DPP8-202ENST00000321147 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELF3P78545 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELF3P78545 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELF3P78545 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELF3P78545 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELF3P78545 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELF3P78545 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELF3P78545 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELF3P78545 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELF3P78545 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELF3P78545 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELF3P78545 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELF3P78545 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELF3P78545 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELF3P78545 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELF3P78545 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELF3P78545 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELF3P78545 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELF3P78545 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELF3P78545 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELF3P78545 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELF3P78545 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELF3P78545 SLC22A23-202ENST00000380302 2883 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELF3P78545 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELF3P78545 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELF3P78545 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELF3P78545 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELF3P78545 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELF3P78545 MICB-202ENST00000399150 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELF3P78545 ZBED6CL-201ENST00000343855 2933 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELF3P78545 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELF3P78545 PNPLA5-205ENST00000597664 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELF3P78545 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELF3P78545 MKNK1-203ENST00000371945 2618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELF3P78545 Z99774.1-201ENST00000382641 2613 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELF3P78545 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELF3P78545 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELF3P78545 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELF3P78545 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELF3P78545 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELF3P78545 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELF3P78545 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELF3P78545 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELF3P78545 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELF3P78545 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELF3P78545 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELF3P78545 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELF3P78545 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELF3P78545 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELF3P78545 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELF3P78545 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELF3P78545 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELF3P78545 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELF3P78545 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELF3P78545 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELF3P78545 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELF3P78545 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELF3P78545 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELF3P78545 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELF3P78545 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELF3P78545 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELF3P78545 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELF3P78545 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELF3P78545 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELF3P78545 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELF3P78545 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELF3P78545 NTM-202ENST00000374786 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELF3P78545 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELF3P78545 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELF3P78545 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELF3P78545 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELF3P78545 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELF3P78545 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELF3P78545 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ELF3P78545 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELF3P78545 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELF3P78545 KARS-201ENST00000302445 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELF3P78545 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELF3P78545 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELF3P78545 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELF3P78545 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELF3P78545 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELF3P78545 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELF3P78545 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELF3P78545 PABPC1-208ENST00000519004 2401 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELF3P78545 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELF3P78545 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELF3P78545 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELF3P78545 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms