Protein–RNA interactions for Protein: P78337

PITX1, Pituitary homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1P78337 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PITX1P78337 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PITX1P78337 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PITX1P78337 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PITX1P78337 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PITX1P78337 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PITX1P78337 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PITX1P78337 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PITX1P78337 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PITX1P78337 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PITX1P78337 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PITX1P78337 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PITX1P78337 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PITX1P78337 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PITX1P78337 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PITX1P78337 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PITX1P78337 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PITX1P78337 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PITX1P78337 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PITX1P78337 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PITX1P78337 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PITX1P78337 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PITX1P78337 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PITX1P78337 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PITX1P78337 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PITX1P78337 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PITX1P78337 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PITX1P78337 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PITX1P78337 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PITX1P78337 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PITX1P78337 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PITX1P78337 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PITX1P78337 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PITX1P78337 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PITX1P78337 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PITX1P78337 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PITX1P78337 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PITX1P78337 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PITX1P78337 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PITX1P78337 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PITX1P78337 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PITX1P78337 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PITX1P78337 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PITX1P78337 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PITX1P78337 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PITX1P78337 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PITX1P78337 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PITX1P78337 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PITX1P78337 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PITX1P78337 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PITX1P78337 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PITX1P78337 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PITX1P78337 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PITX1P78337 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PITX1P78337 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PITX1P78337 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PITX1P78337 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PITX1P78337 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PITX1P78337 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PITX1P78337 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PITX1P78337 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PITX1P78337 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PITX1P78337 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PITX1P78337 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PITX1P78337 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PITX1P78337 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PITX1P78337 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PITX1P78337 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PITX1P78337 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PITX1P78337 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PITX1P78337 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PITX1P78337 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PITX1P78337 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PITX1P78337 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PITX1P78337 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PITX1P78337 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PITX1P78337 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PITX1P78337 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PITX1P78337 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PITX1P78337 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PITX1P78337 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PITX1P78337 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PITX1P78337 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PITX1P78337 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PITX1P78337 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PITX1P78337 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PITX1P78337 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PITX1P78337 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PITX1P78337 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PITX1P78337 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PITX1P78337 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PITX1P78337 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PITX1P78337 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PITX1P78337 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PITX1P78337 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PITX1P78337 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PITX1P78337 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PITX1P78337 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PITX1P78337 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PITX1P78337 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms