Protein–RNA interactions for Protein: P61574

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P61574 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 AC010336.1-201ENST00000539278 4739 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 SHANK2-203ENST00000409161 9208 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 ADNP-203ENST00000396029 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 RTL10-201ENST00000328554 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 YTHDC1-201ENST00000344157 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC11.05□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC11.05□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 ZIK1-204ENST00000597850 4181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 TG-201ENST00000220616 8450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 GREB1-206ENST00000396123 5296 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 SLC24A4-204ENST00000531433 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 MYO1D-202ENST00000394649 5451 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 DLEC1-201ENST00000308059 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 TMEM131L-203ENST00000409959 5017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 MYO18B-202ENST00000407587 8090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 IKZF1-203ENST00000346667 5376 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 C15orf39-202ENST00000394987 4430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 FURIN-206ENST00000610579 4191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 CLPX-201ENST00000300107 4695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 TRUB2-201ENST00000372890 5719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 WIZ-202ENST00000389282 4067 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 PLB1-205ENST00000422425 5115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms