Protein–RNA interactions for Protein: P61247

RPS3A, 40S ribosomal protein S3a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP61247 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RPS3AP61247 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RPS3AP61247 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
RPS3AP61247 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
RPS3AP61247 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RPS3AP61247 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RPS3AP61247 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RPS3AP61247 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RPS3AP61247 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RPS3AP61247 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RPS3AP61247 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RPS3AP61247 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RPS3AP61247 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RPS3AP61247 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RPS3AP61247 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RPS3AP61247 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RPS3AP61247 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPS3AP61247 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPS3AP61247 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPS3AP61247 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPS3AP61247 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPS3AP61247 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPS3AP61247 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPS3AP61247 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPS3AP61247 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPS3AP61247 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPS3AP61247 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPS3AP61247 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPS3AP61247 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPS3AP61247 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPS3AP61247 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPS3AP61247 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPS3AP61247 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPS3AP61247 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPS3AP61247 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPS3AP61247 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPS3AP61247 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPS3AP61247 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
RPS3AP61247 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPS3AP61247 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPS3AP61247 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
RPS3AP61247 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPS3AP61247 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPS3AP61247 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPS3AP61247 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPS3AP61247 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPS3AP61247 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPS3AP61247 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPS3AP61247 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPS3AP61247 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPS3AP61247 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPS3AP61247 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPS3AP61247 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPS3AP61247 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPS3AP61247 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPS3AP61247 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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RPS3AP61247 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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RPS3AP61247 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPS3AP61247 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPS3AP61247 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RPS3AP61247 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RPS3AP61247 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RPS3AP61247 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RPS3AP61247 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RPS3AP61247 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RPS3AP61247 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RPS3AP61247 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RPS3AP61247 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RPS3AP61247 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RPS3AP61247 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RPS3AP61247 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RPS3AP61247 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
RPS3AP61247 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
RPS3AP61247 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RPS3AP61247 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RPS3AP61247 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RPS3AP61247 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
RPS3AP61247 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RPS3AP61247 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RPS3AP61247 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RPS3AP61247 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RPS3AP61247 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RPS3AP61247 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RPS3AP61247 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
RPS3AP61247 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RPS3AP61247 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RPS3AP61247 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RPS3AP61247 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RPS3AP61247 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RPS3AP61247 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RPS3AP61247 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
RPS3AP61247 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
RPS3AP61247 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RPS3AP61247 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RPS3AP61247 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RPS3AP61247 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RPS3AP61247 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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